El CACE participa regularmente en diversos programas de control de calidad externos, los que sumados a los controles internos, permiten obtener resultados confiables y reproducibles.
Algunos de ellos son:
* CEMIC, desde 1986
* Fundación Bioquimica Argentina, desde 1990
* Malbrán, desde 1995
* Facultad de Farmacia y Bioquímica de la UBA, desde 2000
* INTI, desde 2000